Comment réduire cette différence et gagner ainsi de l'espace sur le disque ?

Le formatage du disque dur découpe celui-ci en petites zones appelées clusters dont la taille varie selon le système de fichiers. Par exemple, 4 Ko. Chaque cluster ne peut contenir les données que d'un seul fichier. Par exemple, un fichier de 10 Ko occupe trois clusters.
Les deux premiers sont totalement remplis et le troisième, partiellement.
Mais au final, ce fichier occupe un espace disque de 12 Ko. 2 Ko sont définitivement perdus.
Donc, plus votre disque dur contient de petits fichiers, plus l'espace disque est gaspillé.
Vous avez intérêt à compresser une grande quantité de petits fichiers.
Outre le bénéfice de la compression elle-même, un seul fichier est stocké sur le disque.